Porque tienes dos servidores diferentes, el de tu pc, que tiene tus colecciones y demás, y el de tu NAS, que es un servidor creado desde cero.
Intuyo que tu objetivo es migrar tu servidor con toda su configuración de tu PC al NAS, y solo utilizar este último.
https://support.plex.tv/articles/201370363-move-an-install-to-another-system/
Si el NAS es un Synology mírate este hilo
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