Für Plex dient die Ordnerstruktur dazu, die Zusammenhänge zwischen den Titeln, Alben, und Albenkünstlern abzubilden.
Sie dient nicht dazu, Playlisten zu erstellen, Genres zu separieren oder andere Unterteilungen anzulegen. All das ist besser und flexibler mit Metadaten und Datenbankabfragen zu lösen.
Du kannst ohne Probleme mehrere Mediatheken vom gleichen Typ anlegen. Ich empfehle es dringend, Musik- und Sprach-Audio zu trennen.
Separater Ordner, auf den eine separate Audio-Mediathek “zeigt”.
Da Plex aber keine explizite Unterstützung für Hörbücher hat, muss man die für Musik vorgesehenen Organisationsmethoden nutzen.
Und von Anfang an “Prefer local metadata”/“Bevorzuge lokale Metadaten” anschalten und Audiodateien korrekt mit Tags versehen!
Näheres dazu hier: Hörbüchersortierung mit Plex - #5 by OttoKerner